Zbiory Muzeum Darwina, jak i samo muzeum, nigdy by nie istniały, gdyby nie Aleksander Fiodorowicz Kots, który od dzieciństwa lubił zoologię, kolekcjonowanie i wyjątkowe zainteresowanie wszystkimi żywymi istotami. Jako biolog w wieku 19 lat (1899) wyjechał na Syberię, gdzie zebrał kolekcję wypchanych ptaków, za co otrzymał medal na wystawie jednego z Towarzystw Wszechrosyjskich.
Ponadto młody człowiek współpracował ze słynnym taksydermistą F. Lorenzem, gdzie otrzymywał pensję za te same pluszaki (które stanowiły podstawę jego domowej kolekcji), studiował na uniwersytecie, odwiedzał zagraniczne muzea, gdzie zapoznał się z teorią Darwina, wykładał anatomię na Wyższych Kursach Żeńskich w Moskwie, do których przeniosła się prywatna kolekcja (1907). Do 1964 r. stałym dyrektorem Kolekcji był A. Kots, która przetrwała rewolucje i wojny, ale dopiero w 1995 r. przeznaczono przyzwoitą salę dla Muzeum Darwinana ul. Wawiłow (dom 57).
Dzisiaj wystawy i ekspozycje odbywają się w gmachu głównym oraz w budynku kompleksu wystawienniczego. Oddzielnie wyposażone pokoje dla gości z zaburzeniami ruchu, dla osób niesłyszących, niedosłyszących, niedowidzących i niewidomych; są rampy, windy i windy, co sprawia, że wizyta jest przyjemna i wygodna dla wszystkich kategorii obywateli. Muzeum Paleontologiczne w Darwin oferuje swoim gościom rozbudowane i ciekawe programy, w tym występy kreatywnych zespołów, wycieczki po salach z urządzeniami odtwarzającymi głosy ptaków, demonstrujące ruchome modele dinozaurów, pokazujące, jak toczy się życie w podwodnych wulkanach itp.
Młodzi zwiedzający Muzeum Darwina mogą zapisać się na kursy dla młodych biologów lub odwiedzić pracownię artystyczną i kursy mistrzowskie, ponadto muzeum może wykupić subskrypcje, aby odwiedzić programy, w tym różne instytucje kulturalne w Moskwie. Starsze dzieci mogą zainteresować się wycieczkami wideo po starożytnych ptakach, ewolucji, prehistorycznych światach, w tym w formacie 3D. W salach zoogeografii można zobaczyć wspaniale wykonane wypchane zwierzęta z różnych stron świata, przedstawione w scenerii zbliżonej do ich naturalnego środowiska. Na ścianach znajdują się próbki futra zwierząt, które można pogłaskać. W ekspozycji mikroewolucji możesz spróbować „złożyć” ptaka z różnych części na interaktywnym urządzeniu, które zaśpiewa jego pieśń, jeśli zadanie zostanie wykonane poprawnie.
Dość częstoDrzwi Muzeum Darwina są otwarte dla zwiedzających bezpłatnie. Z reguły dzieje się to w okresie świąt noworocznych lub w dni, w których można zwiedzać poszczególne ekspozycje. Na przykład spektakl świetlno-muzyczny „Living Planet” jest dostępny w weekendy, a trasa „Różnorodność życia” we wtorki – piątki od 16.00, a także w weekendy i święta o 12.00 i 16.30.
Muzeum Zoologiczne Darwina w Moskwie organizuje święta poświęcone konkretnemu wydarzeniu, w tym: Dzień Rodziny, Dzień Ziemi, Dzień Ptaka, Dzień Młodego Ekologa, Dzień Matki, a nawet Dzień Leshy (święto etno). Istnieje również możliwość zwiedzenia muzeum nocą (18 maja) lub zarezerwowania przyjęcia urodzinowego dla grupy dzieci (zawiera bogate zwiedzanie i herbatę w pokoju dziecięcym). Na taką imprezę można zaprosić same dzieci (do 16 lat) oraz dzieci z dorosłymi (grupy nie większe niż 20-35 osób).